Ведущий специалист по данным и моделям / Senior Applied Scientist (удаленная работа)

Вакансия: Ведущий специалист по данным и моделям / Senior Applied Scientist

Описание вакансии

Кситест лидер геномной селекции в России и СНГ, единственная компания с международной аккредитацией ICAR. Мы повышаем продуктивность и здоровье сельскохозяйственных животных с помощью геномных оценок племенной ценности. Среди наших клиентов крупнейшие агрохолдинги страны.

Мы ищем сильного специалиста в команду, отвечающую за аналитическое ядро продукта: пайплайны обработки данных, модели прогноза, математическую оптимизацию и исследовательские задачи.

Вам предстоит участвовать во всех частях разработки продукта от проектирования пайплайнов и моделей до контроля качества результатов, которые получают клиенты. У вас будет прямое влияние на решения, определяющие развитие исследовательской части продукта, и возможность формировать планы и видение этого направления.

Обязанности:

• Проектировать и развивать пайплайны обработки генотипов, загрузки фенотипов, расчёт племенных оценок.

• Поддерживать и улучшать модельное ядро: BLUP / ssGBLUP, оценка дисперсионных компонент, селекционные индексы.

• Развивать инфраструктуру данных: миграция промежуточного хранилища на колоночные СУБД (ClickHouse), проектирование схем, обеспечение идемпотентности и воспроизводимости пайплайнов.

• Вести исследовательскую работу: проверка гипотез по улучшению точности оценок, новые модели, новые признаки.

• Работать с задачами математической оптимизации (подбор пар, минимизация инбридинга, формирование племенного ядра).

• Обеспечивать контроль качества на всех этапах: от сырых данных до финальных индексов, которые видит клиент.

Требования:

• 5+ лет опыта в разработке систем обработки данных на Python.
• Опыт проектирования и поддержки промышленных пайплайнов (загрузка, трансформация, модели, аналитика) не только ноутбуки и прототипы.
• Сильный SQL (оконные функции, CTE, оптимизация запросов, работа со схемами).
• Опыт работы с колоночными или аналитическими СУБД (ClickHouse, Vertica, BigQuery, DuckDB).
• Уверенное владение статистикой, машинным обучением или математической оптимизацией в промышленном контексте.
• Опыт миграции или рефакторинга существующих пайплайнов без остановки работающей системы.
• Самостоятельность: способность разобраться в чужом коде, в незнакомом домене, принять решение и довести до результата.

Большой плюс: почему стоит рассмотреть

• Опыт в биоинформатике, количественной генетике или смежных областях (медицинская генетика, популяционная генетика).

• Знание BLUP/GBLUP, анализа родословных, работы с SNP-данными.

• Опыт с вероятностными моделями (байесовский вывод, MCMC, EM-алгоритм).

• Опыт в доменах с высокой ценой ошибки, где неточность в данных имеет реальные последствия.

Стек и контекст:

• Python (pandas, NumPy, SciPy, SQLAlchemy, boto3) основной язык всех пайплайнов.
• PostgreSQL продуктовая БД, сложные аналитические SQL-запросы.
• ClickHouse целевая СУБД для аналитического хранилища.
• Apache Airflow оркестрация пайплайнов.
• MiXBLUP движок смешанных моделей для расчёта племенных оценок.
• PLINK, KING, Beagle биоинформатические инструменты для анализа генотипов.
• TensorFlow Probability, cvxpy, MOSEK вероятностные модели и оптимизация.
• S3 хранение генотипных данных.

Не обязательно знать всё из списка. Обязательно уметь быстро разбираться в незнакомых инструментах и доменах.

Почему стоит рассмотреть нашу вакансию:

• Уникальный домен. Геномная селекция одна из немногих областей, где модели и инженерия данных напрямую меняют реальный мир: продуктивность стад, здоровье животных, экономику целых регионов.

• Влияние на продукт. Возможность формировать видение и планы исследовательской части продукта, а не просто выполнять задачи по списку.

• Нетривиальные задачи. Смешанные модели на десятках тысяч животных, комбинаторная оптимизация подбора пар, импутация генотипов, мультитрейтовые корреляции.

Условия:

• Гибрид (работа в уютном офисе в центре Москвы/ удаленный формат)
• Зарплата по результатам собеседования

Как проходит отбор:

1. Рассмотрение заявки.

2. Техническое интервью (90 мин): два кейса системный дизайн аналитического пайплайна и исследовательская задача с погружением в домен.

3. Встреча с руководителем компании (30 мин).

Откликайтесь, если хотите развивать аналитическое ядро компании, которая меняет сельское хозяйство с помощью генетики.